O Anuário do Hospital Dona Estefânia, fundado em 1993, é um evento médico anual que assenta em três vertentes:
» Publicação "Anuário do Hospital Dona Estefânia. Repositório Médico Científico": na qual são coligidos os resumos dos trabalhos científicos comunicados e/ou publicados pelo corpo clínico do Hospital em cada ano transacto. É o maior repositório científico de uma instituição de saúde no país. Inclui milhares de resumos científicos importantes, muitos de elevada qualidade e que nunca chegaram a ser publicados. Editado em versão impressa entre 1993-2005, CD-ROM entre 2006-2012 e online (ISBN: 972-96348-5-8) a partir de 2013. Esta publicação é uma edição científica do Núcleo de Estudos Pediátricos do Hospital Dona Estefânia.
» "Reunião do Anuário do Hospital Dona Estefânia": na qual são apresentados os trabalhos científicos premiados de cada Área clínica do Hospital. A Reunião é sempre valorizada com uma Sessão Plenária proferida por conferencista de renome. A entrada é livre.
» "Cursos Satélite" da Reunião: decorrem nos dias próximos à Reunião e são destinados à formação pós-graduada, versando temas de cariz essencialmente prático; a maioria tem avaliação dos formandos e formadores. São organizados em colaboração com a Área de Gestão de Formação e certificados pela Ordem dos Médicos.
